寛政年間に結成された「富山大谷講」が「本山会所」を設け、留守居を置いたことに始まります。
明治3年10月に富山藩から領内の寺院に対して、突如「合寺令（すべての寺院は一宗一ヶ寺にあらため、ただちに合寺すること）」が発布、断行されました。
そのような状況の中で「富山大谷講本山会所」に臨時の説教所が設けられました。

その後、本山へ請願し、明治12年12月に本願寺説教所開設の許可を得ました。更に、明治17年8月には本堂（桁行十六間、梁行十六間、約二百七十坪）、庫裏の新築落成を迎えた頃、説教所から別院への昇格運動もはじまり、政府に陳情を重ねた結果、正式に別院昇格への許可を受けました。

しかし、この本堂は明治18年5月に市内より出火した火災によって灰燼と帰し、再建した仮本堂も明治32年の市中火災で再び焼失。しかし、佐藤助九郎氏（佐藤工業株式会社創業者）の篤信により再び仮本堂が建てられました。

明治40年には教化伝道の本拠として富山教区教務所が置かれました。その後、大正8年11月に別院再建のご消息をいただき、再建記念事業として徳風会館、徳風幼稚園を建設、大正15年に本堂（間口十七間、奥行二十一間、総欅造、約四百坪）の再建にいたりました。しかし、この本堂も昭和14年5月に焼失してしまいます。

その後、再建準備を進めておりましたが、昭和20年8月1日深夜の富山大空襲により、境内総ての建物を焼失いたしました。終戦を経て、戦後復興の混乱期の中で、本堂の再建をめざして仮本堂が建てられました。昭和30年に勝如上人より復興のご消息をいただき、教区の寺院、門信徒の懇念の結集により、昭和42年7月に勝如上人ご親修のもと入仏慶讃法要が勤修されました。それが現在の本堂です。